西暦2100年。世界は生活圏としての都市「メトロポリス」とライフラインとしての生産層「エコロジア」に区別されていた。そこでは互いが互いを助け合い、戦争や貧困をもはや過去のものとしていた。人々が暮らすメトロポリスでは、地上400ｍを誇る超高層ビル群と重力制御によるエアカーを主流とした交通により、ストレスの無い理想の社会を形成していた。その一方で、人類は宇宙へと進出し、月に都市を建て、更なる外宇宙進出を計画していた。

次世代エネルギーの研究者である天箕博士は、月面にある基地で研究チームと共に原子衝突実験を行っていた。しかし、その最中に、突如実験装置から飛び出した2つの光が天箕博士の娘、天箕クラウに衝突し、彼女の体を分解してしまった。しかし、その光は再びクラウの姿を形作り、クラウは「リナクス」として蘇る。ただ、もう1つの光の行方は誰にも分からないままであった。

リナクスとして蘇ったクラウには特別な力が宿っていた。「リナクスの力」を使い、より速く走り、より多くの力を使い、そして空さえも飛べる。そんなクラウのリナクスの力に研究者達は驚き、さらなる研究を進めようとする。しかしそのような娘の姿を見て、天箕博士は呟く、「私の娘を返してくれ」と。そう、彼女はクラウの姿を借りてはいるが、「リナクス」なのだった。どうすれば「クラウ」にこの体を返せるのか「リナクス」本人も分からなかった。

それから10年後。クラウはリナクスの力を隠しながら、悪を取り締まるエージェントとして日々を送っていた。そんなある日、クラウの中からもう1つの光の対である少女「クリスマス」が現れる。
（wikipediaより）